Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms