Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSKSQ9UJT2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms