Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX20Q9UHI6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms