Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms