Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms