Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms