Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms