Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
REREQ9P2R6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms