Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms