Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO1Q9P1Z2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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