Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms