Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms