Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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