Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms