Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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