Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms