Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MID1IP1Q9NPA3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms