Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRHQ9HD43 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms