Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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USP29Q9HBJ7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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USP29Q9HBJ7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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USP29Q9HBJ7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP29Q9HBJ7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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