Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms