Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEBOXQ9HB31 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms