Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms