Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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LHX5Q9H2C1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX5Q9H2C1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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