Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms