Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms