Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms