Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms