Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP53Q96M91 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms