Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms