Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOPBP1Q92547 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms