Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO7Q8WWI1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
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