Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms