Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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