Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3BQ7Z3V4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms