Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L1Q7RTZ2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms