Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC36A4Q6YBV0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms