Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRAIDQ6UW56 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms