Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms