Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms