Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms