Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMYD5Q6GMV2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms