Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRNL1Q5VV63 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms