Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB2Q5VUJ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFCAB2Q5VUJ9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms