Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDSS1Q5T2R2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms