Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms