Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms