Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms