Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms