Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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