Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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